Die E-Rezepte werden beim Transport vom E-Rezept-Fachdienst zur E-Rezept App über eine Transport-Layer-Security-Verbindung verschlüsselt. Dann wird eine weitere Transportsicherung aufgebaut. Sie reicht bis in die vertrauenswürdige Ausführungsumgebung, auf die der Anbieter des E-Rezept-Fachdienstes selbst keinen Zugriff hat.